Bioinformatické algoritmy 25. 1. 2013

Co se jinam nevejde

Bioinformatické algoritmy 25. 1. 2013

Příspěvekod peci1 » 26. 1. 2013 13:39

Ahoj, tak zadani zkousky bylo asi nasledujici:

  • Gibbs - jen popis algoritmu
  • Projekcni algoritmus - popis a nejake povidani o tom, jak urcit k, m, s (ale urcite to nechtel moc dopodrobna)
  • Globalni alignment - definice, algoritmus, slozitost.
  • Uloha. Mame sekvenci DNA a sekvenci RNA po splicingu (tj. bez intronu), obe maji reprezentovat stejny gen. Najdete algoritmus, ktery tu RNA sekvenci zarovna vuci DNA s minimalnim poctem der (protoze pak diry budou odpovidat intronum a my se celkem zadarmo dozvime intron/exon strukturu te sekvence DNA).

Posledni uloha se dala resit jednoduchou upravou affine-gap globalniho zarovnani. Taky to nechtel vysvetlovat moc dopodrobna.
peci1
Matfyz(ák|ačka) level II
 
Příspěvky: 86
Registrován: 21. 1. 2009 20:08
Typ studia: Informatika Bc.

Re: Bioinformatické algoritmy 25. 1. 2013

Příspěvekod Kaelthar » 7. 2. 2013 16:11

Nevíte jestli dává všem stejné zadání nebo dostává každý vlastní?
Kaelthar
Matfyz(ák|ačka) level I
 
Příspěvky: 10
Registrován: 29. 1. 2013 22:55
Typ studia: Informatika Mgr.


Zpět na Ostatní

Kdo je online

Uživatelé procházející toto fórum: Žádní registrovaní uživatelé a 1 návštěvník