Bioinformatické algoritmy 25. 1. 2013

Co se jinam nevejde
peci1
Matfyz(ák|ačka) level II
Příspěvky: 86
Registrován: 21. 1. 2009 20:08
Typ studia: Informatika Bc.

Bioinformatické algoritmy 25. 1. 2013

Příspěvek od peci1 »

Ahoj, tak zadani zkousky bylo asi nasledujici:
  • Gibbs - jen popis algoritmu
  • Projekcni algoritmus - popis a nejake povidani o tom, jak urcit k, m, s (ale urcite to nechtel moc dopodrobna)
  • Globalni alignment - definice, algoritmus, slozitost.
  • Uloha. Mame sekvenci DNA a sekvenci RNA po splicingu (tj. bez intronu), obe maji reprezentovat stejny gen. Najdete algoritmus, ktery tu RNA sekvenci zarovna vuci DNA s minimalnim poctem der (protoze pak diry budou odpovidat intronum a my se celkem zadarmo dozvime intron/exon strukturu te sekvence DNA).
Posledni uloha se dala resit jednoduchou upravou affine-gap globalniho zarovnani. Taky to nechtel vysvetlovat moc dopodrobna.
Kaelthar
Matfyz(ák|ačka) level I
Příspěvky: 10
Registrován: 29. 1. 2013 22:55
Typ studia: Informatika Mgr.

Re: Bioinformatické algoritmy 25. 1. 2013

Příspěvek od Kaelthar »

Nevíte jestli dává všem stejné zadání nebo dostává každý vlastní?
Odpovědět

Zpět na „Ostatní“